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不过，1884年弗洛伊德曾发表一篇16页长的《论可卡因》的论文，论述可卡因的效用。
“这篇文章被认为应该部分地为可卡因在欧洲和美洲的流行负责。”
[43]
但是，历史表明，弗洛伊德的这一转业，其后果远远未被其本人及其老师所料到。
除了经济收入上有了明显的改善之外，主要是走上了一条把所学得的基础理论与临床实践结合起来的正确道路，为他后来创建精神分析学打下了不可缺少的基础。
维也纳综合医院是世界上第一流的医院和研究中心之一。
这里的教授也跻身于奥匈帝国最受尊敬的名人之列，各实验成果也给医院带来显赫的名声。
综合医院位于十几座四边形大楼，共有20个科、14个研究室和门诊部，医生们有一个阅览室，病人有一个图书馆，全院共有2000张病床，每年接纳25000名病人。
从1882年至1885年，在维也纳综合医院工作期间，弗洛伊德先后担任外科、内科、精神科、皮肤科、耳鼻咽喉科、神经科、眼科和小儿科等8个科的医师。
1882年7月31日，弗洛伊德正式到维也纳综合医院工作。
首先任外科临床助手（Aspirant）。
每天在病房工作时间是早上8至10时，下午4至6时，晚上22时至半夜自己看书。
病人临床报告必须记得十分详细。
他没有资格主刀，只是做些助手工作，如清洗伤口、上钳子、缠缠绷带等。
在两个多月的时间里，弗洛伊德参加了外科主任比罗特（Billroth）教授关于十二指肠、胃、唇裂、**瘤等方面的手术，并聆听了多次比罗特教授的讲课。
比罗特认为：“失败应当承认，要立即公开承认，决不能掩饰我们的错误。
了解一个失败的病例比了解十几个手术的成功还要重要。”
对这一点，弗洛伊德的感受颇深，作为一个好医生，不仅要有良好的医术，更要有高尚的医德。
他还发现，比罗特爱好音乐，德国著名钢琴家、作曲家勃拉姆斯（JohannesBrahms，1833～1897）是他的亲密朋友，并且勃拉姆斯的许多作品首先是他在比罗特家里亲自弹奏的。
可以说，“比罗特与布吕克教授很相似：一半是科学家，一半是艺术家”
[44]。
1883年5月，弗洛伊德转到梅纳特精神病治疗所，升任副医师（或译“助理医师”
，Sekundararzt）。
梅纳特是著名的精神病学家和脑解剖学家，他既任综合医院精神科主任，又兼任维也纳大学医学院临床系主任。
这样，梅纳特既可在大学从事大脑研究，又可在医院从事临床治疗。
弗洛伊德在医学院学习时，就非常喜欢听梅纳特教授的课，他对梅纳特极为崇拜。
梅纳特也一直很喜欢弗洛伊德这个既好学又有才华的年轻人。
在精神科五个月的临床工作中，他研究男性精神病患者两个月，研究女性精神病患者三个月，弗洛伊德第一次获得了治疗精神病的知识和方法（如电疗、冷热水浴、溴化物镇静剂等），显露出从事精神病研究工作的卓越才能。
在此期间，弗洛伊德深受梅纳特高尚品质的感染和精湛造诣的熏陶。
看来，对弗洛伊德的重要影响有两项：其一，重视精神疾病的生理机制和生理解剖的科学研究。
梅纳特一再指出：“所有情绪紊乱和精神失常都是由生理性疾病造成的，没有别的任何原因。”
他呼吁同行关注大脑皮质，认为这是“大脑中发挥个性形成功能的部分”
。
他从鼹鼠和蝙蝠开始，做了一百多种动物大脑功能定位的研究，认为自己的贡献在于“大力促进了解剖定位的发展”
。
[47]当然，忽视精神致病作用、把一切疾病均归结为器质性疾病（anicdisease）的器质派的医学观并非科学，但重视一切疾病生理基础的研究是有积极意义的。
这一点，对弗洛伊德早期曾有所影响。
同一个实验室的美国同事伯纳德·萨克斯（BernardSachs）常常喜欢用“精神疾病”
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