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自评自建阶段：被评学校完成自评工作，写出自评材料；专家组抽调学校的背景材料，以及部分学生的毕业设计、毕业论文和试卷等，请同行专家评审、分析。
专家组进校考察阶段：专家组进校听取学校领导的自评报告，采用多种形式深入实际，进行全面考察，通过认真讨论，形成评估意见，并向学校反馈。
评估意见和建议报“普通高等学校本科教学工作评估专家委员会”
审议。
整改阶段：被评学校根据专家组的评估意见，制订整改计划，实施整改工作。
一年后向教育部提交整改总结报告。
1994—2007年，教育部对全国本科高校进行的教学工作水平评估的结果如下。
1994—2000年，用合格评估方案共评估169所学校。
其中：133所一次通过，占78.7%；36所暂缓通过，占21.3%。
1996—2000年，用优秀评估方案共评估16所学校（包括4所试点学校），14所一次通过，占87.5%；2所暂缓通过，占12.5%。
2000年，用随机方案试评1所（长沙铁道学院），评估通过。
2001年，用合格评估方案共评估10所学校，全部通过。
2001年，用随机评估方案共评估25所学校，其中，8所优秀，16所良好，1所合格。
2002年，用合格评估方案评估13所学校，其中，师范类10所，全部合格。
2002年，用教学工作水平方案评估20所学校，其中，13所优秀，7所良好。
2003—2008年，教育部第一轮本科教学工作水平评估的结果见表9-3。
表9-3教育部第一轮本科教学工作水平评估的结果
健全和完善教学工作水平评估制度是保证教学质量的有效手段。
教育部认为，通过教学工作水平评估，有助于把学校的教学基本建设、教学改革及教学管理提升到一个新水平。
评估工作充分显示了评估在端正办学指导思想、规范管理、加大教学投入、改善办学条件、深化教学改革、提高教育质量、创新办学思路等方面，特别是在充分调动全校师生教学和学习积极性、增强学校的凝聚力方面的重要作用。
被评高校普遍认为，本科教学工作水平评估是对普通高校办学指导思想、办学水平和教育质量的全面审视，是促进学校全面发展、提升办学实力的最佳时机，也是发现不足、及时整改的宝贵机遇。
通过迎评促建，被评高校进一步明确了办学指导思想，改善了教学条件，提高了管理水平，进一步加强了师资队伍建设，教学改革得到深入开展，对于学校的教学、人才培养质量的提高起到了非常重要的作用。
有的校领导认为，评估在学校发展历史上具有里程碑意义；多数大学的领导和教师认为，评估不仅使本科教学工作上了一个新台阶，而且使学校的各项工作有了全新的发展。
评估发挥了指挥棒作用，由于在指标体系中要求教授、副教授近三年内要为本科生授课，促使一大批教授重新走上给本科生授课的讲台。
在对高职院校的评估中，由于评估方案把毕业生就业率和职业资格证书获取比例作为检验学校教育质量的核心指标，明显促进了学校以就业为导向的教学建设和教学改革的进程。
随着评估工作的进一步深入和拓展，评估也出现了一些问题。
如表9-3所示，评估优秀率逐年提高，尤其从2006年开始，大幅度提高，评估结论的趋同性增加，教育部评估优秀的部分学校和社会对其的评价存在不一致。
此外，由于评估结果关系到学校的形象、声望和地位，关系到学校的持续、快速和健康发展，个别学校在认识到评估结果的重要性的同时，在迎评过程中不是在以评促建，而是搞应试评估，甚至弄虚作假。
有的学校在评估专家组进校前，集体赶制教师教学档案，补齐学生考卷。
山东某大学一个学生给《中国青年报》编辑部发匿名电子邮件，举报其所在学校为了迎接教育部教学工作水平评估，强迫学生集体作假。
[10]举报信共提到了四项作假手段：首先，“为了迎接评估，学校要求每名学生必须写一份不少于5本书的借书记录，而且要求写明出版日期、借书时间，以表明学校不是没有书，而是好书都在学生手中”
。
但事实上，学校根本没有这些书。
其次，要求大一、大二学生买一张健身卡。
学校规定，这是课外健身的一部分，不参加活动就拿不到相应的学分，毕业时拿不到足够的学分，就会“理所当然”
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