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[3]1993年，中共中央、国务院发布了《中国教育改革和发展纲要》，这是我国跨世纪教育改革和发展的蓝图与纲领。
《中国教育改革和发展纲要》肯定了第四次全国高等教育工作会议确定的思路和方针，并强调要进一步深化高等教育管理体制改革，逐步建立起政府宏观管理、学校面向社会自主办学的体制；要区分不同情况，进一步扩大高等学校的办学自主权；学校要善于行使自己的权力，承担应负的责任，建立起主动适应经济建设和社会发展需要的自我发展、自我约束的运行机制。
按照文件的精神，我国高等学校开始调整既与改革高等教育管理体制、提高高等教育质量和办学效益不相适应，也与高等学校学科和专业发展不相适应的内部组织结构。
第二，建立学院制受到市场机制的影响。
与20世纪50年代院校调整由政府周密计划、依靠行政手段自上而下实施不同，改革开放后，我国高等学校组织结构调整与市场因素有很大的关系，这主要表现在就业市场的推动上。
尽管从80年代中期起，我国就开始探索大学毕业生就业制度的改革，但是在1992年以前，我国高等学校的毕业生仍然按计划分配。
像1987年，我国一方面在353个专业人才奇缺，缺乏大学毕业生达19万人之多；另一方面，有157个专业的毕业生过剩，有十多万名大学毕业生找不到与自己的专业相一致的工作。
尽管过剩与不足并存，但由于有政府分配计划的保证，这并没有对大学的专业结构、人才培养方式和办学理念产生多大的冲击。
进入90年代，随着我国从有计划的商品经济向社会主义市场经济体制的转变，高等教育发展的内外环境也发生了很大的变化。
高等教育不再被视为一种由政府统包统揽的事业，而被视为一种准公共产品。
接受高等教育是个人的一种投资，上大学应该缴费。
毕业生就业制度也应该由国家“统包统分”
向毕业生与用人单位“双向选择”
“自主择业”
转变。
这些观点不仅被纳入1993年颁布的《中国教育改革和发展纲要》，成为我国高等教育领域相应工作的指导原则，而且被广泛地付诸实践。
在这种情况下，高等学校不仅要对政府负责，也要对作为一般消费者的学生负责，使他们尽可能地拥有适应社会发展所需的专业知识和技能，在就业市场上处于相对有利的位置，并具有一定的竞争优势，而这些仅靠各高校原有的学科、专业结构和人才培养方式是无法完成的。
于是，我国高校一方面设立适应经济发展需要的新学科、新专业；另一方面对相邻或相近的学科进行调整，以拓展专业口径，增强适应性，提高大学的竞争力。
在学科、专业结构变化的影响下，我国大学的组织结构也发生了相应的变化。
第三，建立学院制是适应大学管理的要求。
从1977年恢复高考，到20世纪80年代末期，我国高等学校不仅数量增长，而且规模急剧扩大。
1978年，我国5000人以上的高等学校仅有4所，而到1995年，一些规模较大的综合性大学不仅在校生普遍在5000人以上，而且往往由五六十个系、所和中心组成，平均每位校长要分管十多个单位，管理负担很重。
现代管理学认为：一个管理者能够管辖的下属人数或单位是有限的，超过了这个限度，管理效率就会下降，所以任何一级管理机构都应保持一个适当的管理幅度。
一般来说，一位上级管理者以直接领导4～8个下级单位为宜，超过10个，由于组织协调任务太重便难以把握，因此，必须实行分层管理。
在这种情况下，成立学院，建立校、院、系三级组织结构，实行分层管理，不仅可以减轻校长的负担，提高其领导效能，而且可以缩短管理跨度，降低学校业务管理重心，提高运行效率，节约教育资源。
在上述这些因素的影响下，到20世纪90年代后期，我国绝大多数规模较大的高等学校都建立了学院制，形成了校、院、系三级组织结构。
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