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对于评估的组织与实施机制，方案中提出的评估实施过程涉及三个部门的协作：教育部高等教育司、评估专家组和民间中介机构。
高等教育司可以运用其行政权力，较为容易地从各个大学采集到定量指标所需的数据。
高等教育司还有日常工作中积累的关于各校情况的数据资料，既可以作为评估的补充数据，又可以验证届时采集的数据。
专家小组具有教育理论和教育经验的优势，负责采集和分析定性数据资料工作。
民间中介机构是评估活动实施的核心角色。
这个机构必须是专业性的组织，忠于职守，按制度规则行事，不会轻易受到来自教育行政部门和学校的干预。
民间中介机构的工作有三个方面的内容：设计评估工具和评估工作计划；沟通与协调三部门的工作；做出综合评估报告。
方案中建议的评估指标包括定量指标和定性指标两部分。
定性评估的主要内容是学校的办学思想、制度规则和组织文化等的建设和实施情况。
与此同时，教育部也在积极探索对所有高校进行综合水平评估的方法和机制。
除了希望从上述研究方案中得出一些可以借鉴和迁移的内容，用于对高校的全面评估外，自1998年起，教育部的评估网站就开始了综合评估指标选择的调查。
这表明教育部对全国高校综合评价的准备工作已经启动。
3.体现政府政策导向的重点建设项目评估
这种评估的针对性很强，而且多是阶段性的或一次性的评估，评估的目的往往是对项目的实施情况进行检查与验收，或者是促进项目或重点工作的进一步发展。
如1995—1996年，国家对“211工程”
100所左右大学和300多个重点学科点的重点建设规划进行了评估与评定。
2001—2002年，国家又组织了“211工程”
建设项目的验收评估等。
这种评估一般根据同行评议、择优扶持的原则，先由学校提出申请及上交自评报告，然后由教育部组织专家评议或实地考察，最后由教育部审核批准，为限额评选性质的评估。
与此类似的体现政府政策导向的重点建设项目的评估还有在20世纪90年代中后期先后实施的“211工程”
和“985工程”
的基础上，2015年10月，国务院印发《“双一流”
方案》，2017年9月20日，《教育部财政部国家发展改革委关于公布世界一流大学和一流学科建设高校及建设学科名单的通知》出台，指出一流大学建设高校42所、一流学科建设高校95所。
这类评估还包括教育部对其委托与招标的科研项目实施情况的监督评估和验收评估。
此种研究项目评估在高等教育中是应用得比较早、比较普遍的评估类型，但同时也是组织化和制度化水平都不高的评估类型。
尽管高等教育内部的委托项目年年都有，还有常规的五年计划的研究项目的审批、中途检查和结果验收，但这些工作主要靠专家组和科研规划部门来完成，没有专业的评估人员参与，也没有经过严格设计的评估方案和评估制度规则，所以存在一定的随意性和不稳定性。
（二）民间评估机构的出现及其评估活动
1993年1月，国务院批转的《国家教委关于加快改革和积极发展普通高等教育的意见》指出“社会各界要积极支持和直接参与高等学校的建设和人才培养、评估办学水平和教育质量”
。
此后，社会各界对高等院校的办学水平更为关注，民间从事高等教育评估的机构迅速增加，民间的大学排名评估开始活跃。
自1987年中国管理科学研究院科学学研究所发表中国第一个民间大学排名，至2005年广东管理科学研究院发表《2005年中国大学评价》，据粗略统计，中国共有十几家单位发表了40多个大学排行榜，参见表9-4。
表9-41987——2018年中国大学排行榜统计表
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